Zavod je nova ustrojstvena jedinica Klinike koja je počela s radom 3. ožujka 2025. godine. Osnovan je s ciljem poboljšanja kvalitete zdravstvene usluge bolesnicima s upalnim bolestima živčanog sustava, a koji ne zahtijevaju liječenje u Zavodu za intenzivnu medicinu Klinike.
Zavod je specijaliziran za infekcije, ali i druge upalne bolesti živčanog sustava s kojima dijele zajedničke osobine te za neurološke komplikacije infektivnih bolesti. Osnovna aktivnost Zavoda jest rad s hospitaliziranim bolesnicima na odjelu. Pored toga, u okviru Zavoda se nalazi i specijalistička poliklinička ambulanta koja trenutno radi jednom tjedno.
Odjelni liječnici obavljaju konzilijarnu djelatnost te sudjeluju u nastavi studenata Stomatološkog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu. Također se u Zavodu provodi dio edukacije specijalizanata iz infektologije i neurologije.
Medicinske sestre sudjeluju u nastavi srednje medicinske škole i studija sestrinstva.
