Uvod

Klinika za infektivne bolesti «Dr. Fran Mihaljević» javnozdravstvena je ustanova s jasnim znanstveno-istraživačkim profilom koju karakterizira znanstvena izvrsnost u području istraživanja zaraznih bolesti te drugih srodnih disciplina na nacionalnoj i međunarodnoj razini.
Klinika provodi znanstvena istraživanja iz područja zaraznih bolesti s posebnim osvrtom na klinička medicinska istraživanja, ali jednakim intenzitetom podupire i razvija temeljna i javnozdravstvena istraživanja vezana za zarazne bolesti i srodne znanstvene discipline. U svom radu Klinika se vodi načelima znanstvenog integriteta i znanstvene čestitosti, znanstvene izvrsnosti i konkurentnosti temeljene na inovativnosti na nacionalnoj i međunarodnoj razini, znanstvene otvorenosti za suradnju sa svim čimbenicima u znanosti i gospodarstvu na nacionalnoj i međunarodnoj razini te znanstvene odgovornosti za kontinuiran razvoj istraživačke infrastrukture i ljudskih znanstvenih resursa.

Klinika predstavlja jedinstveno okruženje za istraživanje zaraznih bolesti i jedinstvena je institucija koja objedinjuje skrb o bolesnicima sa zaraznim bolestima, vrhunsku laboratorijsku dijagnostiku, klinička i temeljna istraživanja i obrazovanje i osposobljavanje studenata i stručnjaka iz svih medicinskih profila. Postoji i kontinuirana suradnja s farmaceutskom i biotehnološkom industrijom kroz koju su dijelom također sufinancirana znanstvena istraživanja u Klinici.

Kroz svoje djelovanje Klinika kontinuirano promiče stvaranje novih ideja, kritičko promišljanje i kreativno djelovanje u istraživanjima zaraznih bolesti, nastoji održati i unaprijediti svoju poziciju lidera u Hrvatskoj i jugoistočnoj Europi u istraživanju zaraznih bolesti te što bolje se znanstveno pozicionirati u srednjoj Europi, poticati mobilnost svojih istraživača radi stjecanja novih znanstvenih spoznaja i razvoja istraživačkih i ljudskih kapaciteta i kontinuirano snažiti svoju integraciju u cjelokupni Europski istraživački prostor.

Ustroj

Odjel za opasne uzročnike

Odjel za opasne uzročnike specijaliziran je za istraživanje, dijagnostiku te genomsku karakterizaciju visoko patogenih mikroorganizama koji predstavljaju ozbiljnu prijetnju javnom i zdravlju pojedinaca. Odjel provodi laboratorijska ispitivanja i analize kako bi se brzo i precizno odredili uzročnici teških infektivnih bolesti, što uključuje viruse poput ebole, hantavirusa, SARS-CoV-2 i drugih visokorizičnih patogena. Takva laboratorijska ispitivanja omogućuju liječnicima i pacijentima Klinike brzu i ispravnu dijagnostiku raznih uzročnika. Molekularnim metodama se, osim virusa, dokazuju i sekvenciraju opasni bakterijski uzročnici poput Francisella tularensis spp.

Glavne djelatnosti Odjela uključuju razvoj i primjenu naprednih molekularnih dijagnostičkih metoda uključujući metode multiplex detekcije višestrukih respiratornih infekcija i molekularnu epidemiologiju pomoću sekvenciranja visoke protočnosti. Nadalje, u svrhu istraživanja emergentnih virusa, djelatnici Odjela su izolirali i umnožili uzročnike za buduća znanstvena istraživanja. U tu svrhu Odjel održava kolekciju raznih virusnih izolata. Za sigurno rukovanje visoko patogenim uzročnicima, djelatnici Odjela su osposobljeni u raznim referentnim ustanovama u inozemstvu. Sada Odjel provodi i kontinuiranu edukaciju djelatnika u povećanim razinama biozaštite i biosigurnosti.

Za navedene djelatnosti Odjel i njegovi djelatnici sudjelovali su ili sudjeluju u raznim međunarodnim mrežama što osigurava izmjenu znanja i rad na visokoj razini.


Odjel za translacijsku medicinu i imunologiju

Odjel za translacijsku medicinu i imunologiju integrira koncept koji povezuje temeljna i klinička istraživanja s medicinskom praksom tj. laboratorij i bolesnički krevet. Odjel se bavi znanstvenim istraživanjima u području imunologije infektivnih bolesti i imunobiologije uzročnika infektivnih bolesti te također provodi dijagnostiku u području kliničke imunologije s konačnim ciljem primjene rezultata i otkrića istraživanja u radu s infektološkim bolesnicima – odnosno unaprijeđivanja dijagnostičkih, terapijskih i preventivnih pristupa u liječenju infektivnih bolesti. U odjelu rade istraživači i stručnjaci s dugogodišnjim iskustvom rada u području infektivnih bolesti koji njeguju interdisciplinarni pristup i usko surađuju u razmjeni znanja s kliničarima i drugim stručnjacima unutar klinike kako bi se ubrzao prijenos inovacija iz laboratorija u bolničko okruženje.

Odjel za bioinformatiku i statistiku

Odjel za bioinformatiku i statistiku provodi aktivnosti koje uključuju analizu i interpretaciju bioloških podataka uz primjenu naprednih računalnih alata i statističkih metoda. Među ključnim djelatnostima odjela je analiza podataka dobivenih metodama sekvenciranja nove generacije, uključujući genomsku karakterizaciju, analizu ekspresije gena i istraživanje genetske varijabilnosti patogena. Odjel se također bavi razvojem novih algoritama i metoda za analizu genomskih podataka. Nadalje, odjel vrši usluge statističkih analiza u sklopu znanstvenog rada unutar Klinike. Navedeno uključuje metode klasične statistike, epidemiološke analize i primjenu metoda strojnog učenja.

Jedinica za znanstvena istraživanja

Osoblje/kontakt

Odjel za opasne uzročnike
Voditelj odjela: Doc. dr. sc. Ivan-Chriastian Kurolt, mag. biol. mol.
E-mail: ikurolt@bfm.hr

Dr. sc. Barbara Anđelić Dmitrović, mag. biol. mol.
E-mail: bandelic@bfm.hr

Ivona Spudić, univ. bacc. med. lab. diagn.
Ivana Milica Škarec, bacc. med. lab. diagn.


Odjel za translacijsku medicinu i imunologiju
Voditeljica odjela: Dr. sc. Lidija Cvetko Krajinović, mag. biol. mol.
E-mail: lcvetko@bfm.hr

Dr. sc. Željka Mačak Šafranko, mag. biol. mol.
E-mail: zmacak@bfm.hr

Dr. sc. Petra Svoboda Karić, dipl. ing. biol.
E-mail: psvoboda@bfm.hr

Stjepan Mitrović, bacc. med. lab. diagn.


Odjel za bioinformatiku i statistiku
Voditelj odjela: Kristian Bodulić, mag. biol. mol.
E-mail: kbodulic@bfm.hr

Infrastruktura

Infrastruktura i istraživački kapaciteti Klinike značajno su poboljšani izgradnjom nove zgrade Centralnog dijagnostičkog laboratorija koji objedinjava sve dijagnostičke kapacitete i čija infrastruktura je kontinuirano dostupna za sva temeljna i klinička istraživanja koja se provode u Klinici. Značajan doprinos istraživačkim kapacitetima doprinijelo je i osnivanje Laboratorija trećeg stupnja biosigurnosti (BSL3) za dijagnostiku i istraživanje opasnih uzročnika zaraznih bolesti te Laboratorija za stanične kulture.

Široki spektar mikroorganizama danas predstavlja ozbiljan zdravstveni rizik za ljude i životinje, što je postala važna tema za zdravstvenu zajednicu, ali i za vlade i odgovorna državna tijela. To je rezultiralo provedbom različitih mjera biozaštite, usmjerenih na sprječavanje širenja potencijalno štetnih bioloških agensa u okolišu, kao i u zdravstvenim ustanovama.

Jedan dio uzročnika zaraznih bolesti su opasni patogeni koji se detektiraju i inaktiviraju u laboratorijima treće razine biosigurnosti (BSL-3). Razina biosigurnosti 3 uključuje kombinaciju standardnih i posebnih mikrobioloških laboratorijskih praksi i tehnika, sigurnosnu opremu i laboratorijske prostore koji su posebno izgrađeni za tu namjenu.

Hrvatska je endemska zemlja za mnoge od ovih prijetećih uzročnika / bolesti (npr. tularemija, plućna i sekundarna tuberkuloza, bruceloza, Q groznica, melioidoza, tifusna groznica, virusna hemoragijska groznica, hepatitis B i C, HIV itd.).

Strateški geografski položaj naše zemlje i rast međunarodne trgovine i putovanja povećava mogućnost uvoza nekih novih mikroorganizama ili čak pojave epidemije potpuno nepoznatog zaraznog podrijetla. Temeljni cilj BSL-3 laboratorija za rad s opasnim uzročnicima je nadzor i brzo reagiranje, kao ključni elementi u kontroli širenja opasnih infekcija.

U tu svrhu u Klinici za infektivne bolesti „Dr. Fran Mihaljević“ djeluje Laboratorij za biosigurnost razine 3 u kojem se radi dijagnostika opasnih uzročnika. Za sada ta razina nije predviđena za rad s novim koronavirusom (2019-nCoV) prema međunarodnom preporukama, nego će se uzorci testirati u BSL2+ laboratoriju koji je nešto niže sigurnosne razine. Ukoliko nove spoznaje pokažu da je došlo do promjena u novom koronavirusu, koje zahtijevaju višu razinu zaštite, kao što je BSL-3, naši kapaciteti nam omogućavaju rad na toj razini.

Znanstvena istraživanja

Znanstvena istraživanja u Klinici u suradnji s međunarodnim i domaćim partnerima, usmjerena su na brojne aspekte zaraznih bolesti u kojima su ostvareni značajni rezultati priznati na domaćoj i međunarodnoj razini.

Najznačajnije teme istraživanja su: rezistencija na antibiotike, nozokomijalne infekcije, endokarditisi, sepsa, spolno prenosive infekcije uključujući HIV i papilomaviruse, infekcije mokraćnog sustava, zoonoze, bolesti koje se prenose vektorima, hepatitis B, hepatitis C, a u novije vrijeme hepatitis E, infekcije dišnih putova, pedijatrijske infekcije, infekcije u imunokompromitiranih bolesnika, tropske i parazitarne bolesti, imunopatogeneza infektivnih bolesti, i dr.

Više o znanstveno-istraživačkim projektima pročitajte OVDJE